Министерство по природопользованию и экологии Республики Карелия осуществляет следующие функции в рамках государственного экологического контроля (надзора):

-      региональный государственный надзор за геологическим изучением, рациональным использованием и охраной недр (с 2015 года полномочия расширены в связи с добавлением функций надзора в области подземных вод);

-      региональный государственный надзор в области обращения с отходами;

-      региональный государственный надзор в области охраны атмосферного воздуха;

-      региональный государственный надзор в области использования и охраны водных объектов;

-      региональный государственный надзор в области охраны и использования особо охраняемых природных территорий;

-      контроль за соблюдением законодательства об экологической экспертизе при осуществлении хозяйственной и иной деятельности на объектах, подлежащих региональному государственному экологическому надзору.

Функции государственного экологического контроля (надзора) в Министерстве выполняет отдел государственного экологического надзора.

Под региональный экологический контроль (надзор) на территории Республики Карелия попадает около 40 тысяч юридических лиц и индивидуальных предпринимателей, осуществляющих хозяйственную деятельность, 325 лицензий на разведку и добычу общераспространенных полезных ископаемых, 79 лицензий на пользование подземной водой, более 70 водных объектов, а также 136 ООПТ регионального значения общей площадью 416 260,16 га.